五年十二月，起为内弘文院学士。六年，充会试总裁。八年，大学士刚林、祁充格得罪，文奎以知睿亲王多尔衮令改实录不上言，当坐，上命免议。四月，复命以兵侍郎、左副都御史，总督漕运，巡抚凤。请复姓沈氏。七月，疏请慎选运官，清舍馀，合选殷丁，清勾黄快，皆漕政大端，凡四事。十年，率师讨胶州叛将海时行。十一年，遣兵捕硃周錤，清通、泰滨海逋寇。江北庐、凤、淮、扬诸府灾，文奎请蠲赋，议未定，冬尽未启徵。九月，文奎坐督运愆迟，左迁陕西督粮。寻卒。

寻命加兵右侍郎，总督陕西。五月，改命总督淮、扬漕运。淮、扬群盗，忠、魏用通、升三人者为之魁，复有酆报国、司基挟明宗室新昌王，与相应为。文奎遣游击裴应旸等击斩用通，总兵王天亦击破升，报国、基为其徒缚诣江宁以降；忠走崇明，亦降。十二月，复令总兵孔希贵、苏希乐逐盗如皋，得其渠于锡籓、刘一雄。三年八月，又与淮徐张兆熊发兵击斩邳州盗杨秉孝、王君实等。江、淮间始稍安。十月，疏请禁革苏、松诸府徵漕积弊，悉去官、儒、济农仓诸名，著为令。四年正月，以擅免荒田赋，又渎请明陵祀典，夺职。

竞占，逋赋为州县吏累，文奎疏请招民分耕纳赋；二年正月，疏言畿南民重困，岁贡绵丝诸品，皆求诸他行省，请改折；二月，又论诸卫所地纳赋丁保甲，皆当属州县吏：并见采择。李联芳、张成轩等为盗南、盐山间，四月，遣都司杨澄、守备徐景山捕治，戮联芳等九十三人。

贡明隶镶红旗，亦诸生；应元隶正白旗，自署“隐士”

李栖凤，字瑞梧，广宁人，本贯陕西武威。父维新，仕明为四川总兵官。尝官蓟、辽，家焉。鸣佩字甫，辽人，本贯山东蓬莱。其先世尝为辽东保义副将，因占籍辽左卫。栖凤、鸣佩皆以诸生来归，事太宗，并值文馆。崇德元年，甄别文馆诸臣，栖凤、鸣佩俱列二等，赐人、牲畜。汉军旗制定，同隶镶红旗。世祖定鼎，授栖凤山东东昌，鸣佩山西冀南。顺治二年，收湖广，移栖凤上荆南，鸣佩下湖南。

七年，又有扈应元者，疏诋汉官但求名利，语近戆，略如贡明。别疏陈七事，谓备荒宜储粮；编丁宜恤老？；筑城建关宜不妨农业；师宜选公正廉能吏，拊循新下郡邑；取士宜尚德行；求言宜置谏官；乘机取天下，在人心不在火。上览其疏，至论筑城建关，疑勿善也，不竟阅。应元亦上疏抗辨。

方栖凤值文馆，治事勤慎，达海等闻于上。上命司撰拟，移写国书。达海卒，栖凤言文馆无专责，椟贮官文书，人得窃视，虑有漏言。上召王文奎等谘和议成否，栖凤上疏言：“臣侍文馆几七年，今上与南朝议和，谋及群臣。臣愚以为时政有可惜者二，当速图者六。先帝劳心力、训练劲旅以遗上，上当法先帝赏罚独断，有功虽贱虽仇必赏，有罪虽贵虽亲必罚。若不振奋鼓舞，必且习为，弛已成之业。此可惜者一也。上天姿英，诚大有为之君也。臣见诸臣章奏，辄曰‘上宽仁大度’，此则谀耳。创国之君，不过刻，亦不过宽。用人听言，审察其可否，中夜而思，如何使人畏，如何使人喜，而后可以驱使。倘信虚誉而毗于仁厚，必误上英矣。此可惜者二也。民以为天。今岁且螟，米值骤昂。上宜速师攻关外八城，八城为我有，岂复虑我民之枵腹耶？一失此机，民无且散，国亦稍稍衰矣。当速图者一也。上旧得人民，兵农工役，皆备。惟频岁役民筑城，此毁彼建，不得休，民未必无怨。昨闻大凌河西夷复加诛戮，奈何先与之誓而后又杀之也？今宜

与文奎同时以诸生直文馆者，云、应时同被召对。又有李栖凤、杨方兴、士俊、国、鸣佩、雷兴辈，盖皆文奎疏中所谓秀才八九者也。栖凤、方兴、国、鸣佩、兴自有传。云后不著。应时为启心郎，以祝世昌请毋以俘妇为，为改疏稿，坐死。士俊尝上疏谓：“上定例一丁予田五日，衣于此，力役于此。民已苦不足，况以绳量田，名五日，实止二三日。将吏复占沃地，役民以耕，宜禁革。民间贷金，当视金多寡定取息重轻，其有逾度者，宜坐罪。”日者，满洲以计田，土俊用当时语也。士俊关后，尝为湖广巡抚，收长沙，克衡州、常德，有劳。

方上召文奎等策议和成否，亦谕吏民令建言。有胡贡明者，疏言：“我国与南朝未尝无内外君臣之分。今既议和，当遣使修表，姑听其区画。如不为之下，遂图大事，必如汉祖而后可。”因谓鼓舞用人，养百姓，立法令，收人心，皆未若汉祖。贡明先尝上疏请更养人旧例，略言：“太祖时方草创，土地、人民、财用皆与诸贝勒均之。今尚沿此习，上名虽有国，实不啻正黄旗一贝勒耳。一人寸土，上与诸贝勒互不相容。十羊九牧，即有中原不可以为治。师得财，当以三属上，七分畀诸贝勒。得人聚而赎之，视其贤不贤，厚薄予夺，权得以自，而人心亦归于一。”至是又别疏申前说，并反覆言养豪杰当破格，如祖之于“三杰”上览先疏，颇韪其语，谓后师当用汝议；览后疏，责其语冗。贡明复上疏抗辨。