过多干涉高丽内政，所以也不深究。双方因此避免了一场冲突。

万昌十一年，同为武臣的大将军韩顺、将军韩恭、史直哉等人，不满李高、李义方等人滥杀无辜。李高得知此事后，将这些带有不满情绪的武臣全部杀害。由此揭开了武臣之间相互屠杀的序幕。李高、李义方本有宿怨，李高对李义方有两点不满。第一点，李义方在朝廷里仍然起用了一部分文臣，而李高认为朝廷应该完全由武人来掌控；第二点，李义方在新设立的“重房”机构中，不断排挤李高。两人矛盾爆发，最终李义方成功击杀李高。

李高死后，他的部将蔡元准备请地方军入京给李高报仇。李义方事先得知消息，又将蔡元杀害了。同时为免后患，李义方开始在京城大肆捕杀李高、蔡元的亲朋。这时候去了辽国的庾应圭带了辽国特使耶律靖回到了高丽。耶律靖提出要见退位的毅宗，被郑仲夫、李义方拒绝。不过，武臣们收买了耶律靖，请他说服辽皇帝承认明宗。一年后，辽国的圣旨下来，正式册封明宗为新的高丽国王。现在，武臣之间的矛盾，转移到了李义方和郑仲夫身上。李义方在除去李高的行动中积攒实力，逐步压过了郑仲夫。不久，李义方借明宗圣旨任命郑仲夫为“判西北面兵马事”企图将他外调。

就在李义方和郑仲夫在明争暗斗之际，东北面兵马使金甫当，起兵攻打京城。金甫当提出复前王、杀奸臣的口号，笼络了大批将领以及朝中大臣，企图内外夹击拿下开京。在此之前，金甫当已经秘密派人到巨济岛救出了毅宗，把他安置在讨伐军的本部庆州。

李义方、郑仲夫得到消息后，停止了内部争斗，派遣李义旻、朴存威等将领率领大军前往抵挡。李义旻，是李义方的族弟，身长八尺，臂力过人，是个有名的大力士。早年他横行乡里，依靠着族兄李义方当官的势力，欺压良民。后来他被李义方选入军中，经常给毅宗表演“手搏戏”第一次武臣政变中，李义旻也给李义方立了不少功劳。李义方待他犹如自己的亲生弟弟，视为己出。这次派李义旻去对抗金甫当，正是要历练他的军事领导才能。

在与金甫当的战斗过程中，李义旻又得到了大将杜景升的相助。杜景升曾经反对过李义方发动武臣政变，李义方爱惜他的军事才能，才没有杀他。这一次，杜景升帮助李义旻作战，令李氏兄弟颇感意外。后来，杜景升的地位逐步提高，成为武人中一个很重要的力量。

在李义旻、杜景升等人攻打之下，金甫当的讨伐军大败。李义旻生擒了金甫当，将他押送到京城。从金甫当及其手下的口中，李义方得知朝廷中也有人与他们勾结。随后，李义方又掀起了一股屠杀狼潮，在京城内大肆捕杀文臣。有些武臣想趁机除掉所有文臣，捉拿了宰相尹鳞瞻。庾应圭为了救尹鳞瞻，只身犯险到了李义方的军营，请求他释放尹鳞瞻。李义方考虑到尹鳞瞻的政治才能和声望，为收买人心将他释放。不久，李义方也停止了京城内的屠杀行动。

然而，毅宗还活着，始终是让人头疼的。李义旻本来就是庆州人，对庆州了如指掌。他秘密潜入庆州，将毅宗骗到了坤元寺。李义旻、朴存威将毅宗杀害，并把他的尸体投入坤元寺附近的河川之中。后来坤元寺的僧侣把毅宗的尸体捞了上来，暗地里埋在了坤元寺的菜园内。