纯皇太后谥号,诏告天下。
四月二十一日,程国祥辞官退职。这月,左良玉攻击降贼首领李万庆。五月八日,礼部侍郎姚明恭、张四知、兵部侍郎魏照乘均为礼部尚书兼东阁大学士,参与机要事务。九日,张献忠在谷城起兵反明,罗汝才等相继起兵响应,一举攻克房县。十九日,孙传庭革职,不久被逮捕入狱。六月,畿内、山东、河南、山西天旱,起蝗虫。二十三日,抽调各镇精兵进行训练,又增加练兵粮饷。
七月十七日,左良玉征讨张献忠,在罗猴山失败,总兵官罗岱被活捉处死。熊文灿被革职,不久逮捕下狱。八月八日,下诏诛杀边境失事巡抚都御史颜继祖,总兵官倪宠、祖宽,内臣邓希诏、孙茂霖等三十三人,全部弃市示众。十四日,减免唐县及其他四十州县去年田租的一半。二十七日,大学士杨嗣昌率军征讨贼军,总督以下全部听其节制。
十月初一日,杨嗣昌在襄阳誓师。十一日,左良玉为平贼将军。十三日,《钦定保民四事全书》修成,颁布于天下。十一月二十八日,在京师南郊祭祀天。十二月,罗汝才侵犯四川。二十四日,下兵部尚书傅宗龙于狱。
当年,琉球入朝进贡。
崇祯十三年(1640)闰正月三日,赈救真定饥荒。六日,赈救京师饥民。二十一日,赈济山东饥荒。二月初一日,在东郊祭日。七日,总督三边侍郎郑崇俭在太平县玛瑙山大败张献忠,张献忠败走归州。二十七日,因长时间干旱,征求直言。三月三日,祈祷雨。五日,大风沙,下诏清理刑狱。七日,罢免各镇内臣。十七日,赐魏藻德等进士及第、出身各有不同。十九日,赈救畿内饥荒。二十八日,减免河北三府欠交赋税。
四月七日,逮捕江西巡抚佥都御史解学龙及他推举的黄道周。二十八日,吏部尚书谢升为礼部尚书,礼部侍郎陈演以原官兼东阁大学士,参与机要事务。五月,罗汝才攻打夔州,石石主女土官秦良玉连续战退罗汝才。四日,在北郊祭地。三十日,姚明恭辞官退职。六月初一日,总兵官贺人龙等分路追击罗汝才,罗汝才兵败,移师大宁。二十日,蔡国用死。二十一日,薛国观停职。
七月初一日,畿内捕捉蝗虫。十日,发放钱币赈救遭受蝗灾州县。十二日,左良玉及京师营兵总兵官孙应元等在兴山大败罗汝才。罗汝才败走巫山,与张献忠会合。八月二十五日,赈救江北饥荒。九月,陕西官军将李自成围困于巴西鱼腹山中,李自成因逃走幸免。十五日,张献忠攻陷大昌,总兵官张令战死。不久又攻克剑州、绵州。
十月六日,熊文灿被斩首示众。十一月,杨嗣昌进军重庆,十日,在南郊祭天。十一日,南京发生地震。十二月初一日,严格抄传军事机密禁令。五日,张献忠攻陷泸州。九日,逮捕薛国观。这月,李自成从湖广到河南,饥饿农民争先恐后跟随李自成。连续攻陷宜阳、永宁,杀万安王采。。,攻陷偃师,声势大震。
当年,两畿、山东、河南、山西、陕西天旱,蝗虫大起,人相残食。