希仪镇守柳州、庆州很久,大盗宿猾被捕诛殆尽。先后捣毁敌巢,斩敌人积有五千多个,未尝全部上奏报功,所以多不叙功。十九年(1540)又谢病,柳人在山云洞为他祭祀。不久被起用为四川左参将,分守叙州、泸州和贵州迤西等处。这一年冬天,被提升为署都督佥事,充任总兵官,镇守贵州。又谢病回到家乡。塞上多警,朝廷召令天下名将到京师,沈希仪在召之中。沈希仪镇守柳、庆时,每战必身先士卒,身体多次受伤,遇阴雨天气总是剧痛,所以多次谢病。到京后,也因病辞谢。皇帝怀疑他是回避,夺去他的都督官职,命令他赴兵部听候调用。翁万达推荐他的才能。正遇上江、淮多盗,议设督捕总兵官,于是恢复沈希仪署都督佥事官职前往剿匪。
二十六年(1547)任沈希仪为广东副总兵。命自今将领至四川、广西、云南、贵州者,毋推京营及西北边,著为令。沈希仪随从总督张岳大破贺县的敌贼倪仲亮等人,予实际授官,仍然赏他银币。琼州五指山熟黎向来畏法,供徭赋,知州邵氵睿残虐榨取他们的血汗。黎酋那燕于是勾结崖州、感恩、昌化诸黎作乱。总督欧阳必进提议一并讨伐万州、陵水之黎,兵分五路。沈希仪正在患病,最后到来,他对欧阳必进说:“万州、陵水之黎人没有从恶的事实,如果一并诛讨,更加树敌。不如只分兵三道。”欧阳必进听从了他的话。沈希仪于是偕同参将武鸾、俞大猷等人直入五指山下,斩那燕及其党徒五千四百多人,俘获的有五分之一,招降三千七百人。捷报奏闻朝廷,沈希仪晋升为都督同知,改任贵州总兵官。又从张岳军定铜仁的叛苗龙许保、吴黑苗等人。又因病回到家乡。倭寇侵犯海上,命令沈希仪督川、广之兵赴剿。无功,沈希仪被周如斗弹劾罢去官职。
沈希仪为人坦率,常居喜欢说俏皮话,性格开朗,没有城府。等到面临敌人,则应变出奇,让人莫测。特别善于安抚士卒。沈希仪经常染病垂危,士卒多自残来向神祷告。甚至有一人,为沈希仪祈祷到达用箭穿自己咽喉的地步。沈希仪是如此深得士卒之心。
石邦宪,字希尹,贵州清平卫人。嘉靖七年(1528)承袭世职为指挥使。累功,晋官署都指挥佥事,充任铜仁参将。苗人龙许保、吴黑苗反叛,总督张岳提议征讨他们,而敌贼攻陷印江、石阡,石邦宪被坐罪逮问。张岳因为铜仁是敌贼的巢穴,而石邦宪有勇有谋,于是上奏留用石邦宪。石邦宪于是与川、湖之兵共进贵州,攻破苗砦十分之五。躲藏在山中竹林子里的人,被搜杀殆尽。上功,石邦宪居第一。未及叙功,而龙许保等人突入到思州,捉住知府李允简而去。石邦宪紧急半路拦击,将李允简夺回来了。石邦宪被停止俸禄,让他戴罪立功。敌贼攻破思州后,又纠集余党,与湖广蜡尔山苗人会合,想攻石阡。没有攻克,经过省溪而回去。千户安大朝等人半路拦击他们,俘歼敌人大半,夺下敌贼的全部辎重,敌人溃不成军。石邦宪于是让使者重金收买老。。、老亻革等人擒住龙许保送到军门,而黑苗如过去一样躲藏。又用计重金收买乌朗土官田兴邦等人斩黑苗,敌贼于是被平定。石邦宪于是晋为署都督佥事,充任总兵官,代沈希仪镇守贵州。
台黎砦苗人关保倡导作乱,四川容山、广西洪江诸苗响应。远近骚然,朝廷上是安抚还是剿歼不能定下来。石邦宪与湖广分兵讨破他们,传檄十八砦,许他们捉拿首恶赎罪。诸苗听从安抚,设盟受约而回去。
播州宣慰杨烈杀长官王黼,王黼的同党李保等人治兵相攻快有十年,总督冯岳与石邦宪讨平他们。真州苗人卢阿项作乱,石邦宪用兵七千人编筏渡江,直抵磨子崖。估计敌贼必定来进行夜袭,预先防备。敌贼到达后,被他们击败。敌贼向播州吴鲲求援。诸将感到恐惧,石邦宪说:“水西宣慰安万铨,是播州所畏怕的。我调水西之兵攻乌江,声讨杨烈纵吴鲲助叛逆之罪,杨烈哪有空暇救人呢?”之后,水西之兵到达。石邦宪进逼敌人的巢穴,乘风放火,斩关而登,敌贼大崩溃,擒住敌贼首领父子,歼俘四百七十多人。石邦宪晋署都督同知。
石邦宪攻破地隆阡叛苗四砦,又攻破答千诸砦,擒住他们的巨魁。地隆阡派遣敌贼龙老三、龙得奎勾结龙停苗人老夭、扳凳苗人石章保等人纵兵抢掠,捉拿石耶洞土官的妻子冉氏带回去,攻击梅平砦。官军要擒拿龙老三。龙得奎走脱幸免,又与老夭等人攻破平南营囤。石邦宪侦察得知冉氏在老夭那里,表面议说要赎她,而暗中击杀老夭。官军于是进入龙停砦,一并捉拿扳凳砦苗人龙老丙,命令他献出石章保。由此诸苗全部被降服。白洗、养鹅的诸苗反叛,石邦宪征讨并擒住敌魁,降服一百多砦。
湖广溆浦瑶人沈亚当等作乱,总督石勇檄令石邦宪讨伐他们,石邦宪生擒沈亚当,俘歼二百多人。甫溆浦平,铜仁、都匀的苗人互相煽动进行反叛。石邦宪亟驰回来,率领守备安大朝进剿。先攻破彪山砦的敌贼,乘胜以谋略平定诸砦。俘虏敌贼的头子龙老罗、王三等人,余党全部平定。石邦宪又与总督黄光升,修筑湖北的墩台、烽土侯一百多所,招降冷水溪诸洞苗二十八砦。